2月26日，中国海关总署动植物检疫司发布通知，决定2天之后，即自2021年3月起，“暂停台湾地区菠萝（凤梨）输入大陆”。国台办发言人马晓光表示，这是因为海关多次从台湾输大陆的凤梨中检出有害生物，而“有害生物一旦传入，将对大陆农业生产和生态安全造成严重威胁”。台湾农委会主委陈吉仲迅速回应，称中国海关总署单方面终止输入是不符合国际规范的作法，感到“遗憾、不解”。农委会官员表示，按照过往经验，若水果外销发生病虫害，通常会透过薰蒸、要求业者退运等方式处理，且台湾凤梨过往测出相关虫害的纪录良好、数字并未特别高，这次却以行政命令单方面终止输陆，相当罕见。
海关总署所指在台湾凤梨中发现的“有害生物”，是大洋臀纹粉蚧（Planococcus minor）、新菠萝灰粉蚧（Dysmicoccus neobrevipes）和菝葜黑圆盾蚧（Melanaspis smilacis）三种介壳虫。介壳虫，在台湾是常见害虫，常寄生于凤梨、释迦、荔枝等作物，前两者也同时在中国大陆现踪，第三种仅在台湾出没。
这对于许多产地农民来说，不啻是晴天霹雳。因为，凤梨的产季即将来临，这些预备销往大陆的鲜果，即将在清明节前后进入盛产期，滞销危机迫在眉稍。面对此一局面，不少台湾民众第一时间质疑，是否因为政治因素而导致凤梨输陆急喊停？陈吉仲回应，“除了政治订单以外，大部分两岸贸易都是市场贸易，没有任何政治因素在其中”，陈吉仲并向对岸喊话，期待能从“市场专业”角度来处理此一议题，不要让农民因为“非市场因素”而受害。陈吉仲的措词谨慎，希望将问题框定在“市场”范围的手势，十分清楚。
根据农委会国际处统计，过去三年（自2018至2020年），台湾农产“主要销陆水果”（即指外销途径中超过九成以销往中国大陆为主的水果），为槟榔、莲雾、凤梨释迦、凤梨、葡萄柚与柳橙。其中，凤梨外销的总量中，销往中国大陆的比例高达95.2%，近三年累积销往中国大陆12万2876公吨、产值1亿5523.2万美元，产量与产值均为六大销陆水果之冠。