台灣衛生福利部食品藥物管理署（食藥署）於7月1日公告，將兩款事後避孕藥及一款人工流產藥納入流向追蹤管理，預告期60日，並研議未來要維持「需要醫師處方才能取得」或改為「藥師指示即可用藥」。此一公告引發爭議，並受到醫療、藥師及婦女團體各自批評，爭議核心在於避孕藥品取得的「可近性」與「醫療自主權」，國際上已有約90國允許民眾到藥局直接購買事後避孕藥，台灣卻維持需醫師處方箋才能領取的管制方式，引發外界對限制女性身體自主權的質疑。
三款藥物是什麼？
食藥署指出，本次公告兩款事後避孕藥與一款人工流產藥：Levonorgestrel、Ulipristal acetate 與Misoprostol。因疑似出現網路非法販售情況，希望透過追溯系統的申報與比對機制，掌握藥品自藥商至醫療、藥事機構售出後的供應流向，保障民眾用藥安全。
本次將納入流向管制的三款藥物中，前兩者功能相似：Levonorgestrel（LNG）是人工合成黃體素，可以抑制排卵和子宮黏液增厚，以此達到避孕效果。這類藥物在性行為後72小時內使用，愈早服用避孕成功率愈高。目前全球約有90個國家已將 LNG 列為非處方藥，可直接至藥局購買。但在台灣、韓國、新加坡等國則需要醫師開立處方箋才能取得。
而 Ulipristal acetate（UPA）是選擇性黃體素受體調節劑，在性行為後120小時內可用，同樣愈早服用成功率愈高。因效果較LNG強、時效更長，有56國開放民眾直接在藥局購買。
藥師陳宜萱提醒，服用事後避孕藥後，無論有無不適，均建議在性行為後14天左右，或是月經延遲一週以上時進行驗孕，或是至婦產科追蹤。
第三種藥物 Misoprostol 則是前列腺素類似物，原為胃及十二指腸潰瘍治療藥物，與Mifepristone併用可終止49天內早期懷孕，用途是人工流產，並非事後避孕，目前在多數國家均列為處方藥。
管制爭議
早在2016年，台灣食藥署便通過決議將LNG從處方藥轉為指示藥，意味著有需求的民眾不需再經由醫師開立處方箋，而是可以直接至各地藥局購買，但相關規範遲遲未公告上路。
反對轉類的聲音主要來自婦產科醫界。台灣婦產科醫學會於2025年1月發布聲明，「堅決反對」將LNG轉為指示藥，主要理由包含：臨床上醫師會要求服藥者兩週內回診，因服藥後可能經期紊亂，難以判斷避孕是否成功，若未回診恐延誤發現懷孕，而藥師無法提供進一步診察；其二，事後避孕藥仍有機率失敗，且對子宮外孕無效，若未及時發現可能引發內出血甚至死亡；另外聲明認為台灣就醫便利，無須比照國外，且開放 LNG 轉為指示藥，恐讓無保護的性行為增加，危及婦女尤其青少女健康。學會呼籲維持現行處方藥管理並嚴格執行。
謝達文
而外界對食藥署公告的質疑主要在於，加強管制舉動究竟是「管制藥品流向，還是管制女性身體」。食藥署強調，是為了確保業者落實申報，以利主管機關即時進行流向查核及統計，不會追蹤個人資訊。
不過，輿論延燒還未平息，現任衛福部次長、前婦產科醫師林靜儀7月1日在臉書發表意見後，此波爭議又達到高峰。最受詬病的部分在於她寫下「男人沒有準備保險套就不要跟他上床」，遭人質疑暗示了尋求事後藥的人是未用保險套，並將不安全性行為的責任歸咎於女性，卻忽略了保險套避孕並非100%安全。
林說明，此次食藥署沒有改變取得藥品和獲得用藥的方式，而是疑似有大量相關藥物流向不明，遭違法濫用甚至盈利，因此才會預告對藥物流向進行管理。林所指的藥物流向不明，可能係指日前印尼籍移工女子非法售賣 Misoprostol案件。基層藥師協會理事長沈采穎接受媒體採訪時指出，此波管制起源於外籍人士私下利用相關藥物為同鄉墮胎。然而，為何「流產藥物」黑市失控，管制卻要納入另兩款成份與功效都不同的「事後避孕藥」，食藥署與林靜儀都未能公開解釋，林僅稱相關案件已由檢調著手調查。
而在7月2日，民間團體與多名民進黨立委召開記者會，要求食藥署應暫緩推動草案，並公開政策的風險及性別影響評估，納入女性的實際需求及婦女團體的意見，並推動健康教育及諮詢等配套措施。
民間團體台灣女人連線表示，相關管制可能會增加女性取得事後避孕藥的困難，尤其是對醫療資源不足的偏鄉地區、遭受性暴力者或需要緊急取得藥物的女性。台灣女人連線曾於2024年進行問卷調查，結果顯示約65%民眾支持放寬管制，理由是方便即時取得以及提升女性孕產自主權。
民進黨立法委員張雅琳表示，追蹤管制可能增加藥局端的負擔與法律風險，尤其可能影響小型、偏鄉或是夜間營業的藥局，導致部分藥局停止進貨與販售。當合法取得管道減少，女性可能轉向風險更高的非法管道尋求藥物，或是必須承擔非預期懷孕的後果。
除民間團體外，也有民眾於7月初在公共政策網路參與平台上提案，要求政府「將事後避孕藥改為可直接在藥局購得的非處方藥師指示藥」，直到7日已獲得1萬餘人附議，該平台的提案若獲得超過5000人附議，政府機關便有義務在2個月內回應具體研議的結果。
衛福部部長石崇良則在7月5日出席活動時說明，未來有兩個調整方向：直接把事後避孕藥從現行需要由醫師開立的處方藥，改為民眾可以直接在藥局購買的指示藥；另一方向則是參考日本作法，採「醫師處方」及「藥師指示」雙軌制，確保女性服藥時能獲得專業指引。日本在2026年2月取消未成年人購藥須家長同意的規定，同時設立配套措施：要求本人到場、須在藥師面前當場服藥，且唯有符合厚生勞動省相關門檻要求的藥局才能販售；若前往不符要求的藥局，仍須持處方箋購買。
馬偕醫院婦產科主治醫師黃閔照表示，較理想的避孕方式是事前避孕藥搭配保險套。他說，事後避孕藥是在未採取適當避孕措施後72小時內使用，可能出現不正常出血等副作用，仍有子宮外孕及避孕失敗等風險。對於改制問題，他認為，事後避孕藥雙軌制具可行性。
國立台灣大學公共衛生學院健康行為與社區科學研究所副教授官晨怡表示，「女性若能在關鍵時刻擁有身體自主權，並及時取得生殖健康資源，就有機會避免非預期懷孕造成的身心負擔。」她稱，從公共衛生的角度而言，支持女性在風險發生前或發生當下獲得適切照護，不僅有助於改善個人健康，也能降低家庭與社會後續必須承擔的成本。
官晨怡強調，世界衛生組織（WHO）長期將避孕措施視為促進女性健康與生殖權利的重要公共衛生策略，「在政策設計時，應以女性照護需求為優先，而非讓制度門檻成為新的健康障礙。」
本次公告預告期60日，將於8月底屆滿，而公共政策平台提案依規定政府須於2個月內回應；林靜儀所稱檢調偵辦中的案件，其調查結果也將影響管制方向。
