9月7日晚開始，香港各地普降暴雨。香港天文台在8日凌晨1時15分發布的天氣報告指天文台總部在7日11時至午夜12時錄得一小時雨量達158.1毫米，為1884年有記錄以來最高。而根據天文台的雨量數據，大埔、北區到羅湖關口一帶過去24小時累積雨量已經超過400毫米。其中大部分應該都是7日晚開始積累的降雨。
毗鄰香港的中國大陸廣東省深圳市也遭大暴雨，根據當地自動氣象站監測數據，羅湖區多地六小時內降雨量超過300毫米。其中東門街道自動站錄得340毫米以上，累積24小時雨量超過450毫米。根據社交網絡上的消息，羅湖區內大量區域內澇甚至停水停電。
暴雨由上週襲擊台灣的颱風「海葵」餘波影響。「海葵」離開台灣後再度在福建登陸，其後成為一個低氣壓進入廣東。然而其「吸水」能力仍然強勁，更得到西南季風的充沛水氣，造成對流雲團的「列車效應」，帶來超強降雨。
「海葵」的相關雨帶在7日晚上大幅影響珠江口地區。香港天文台在1小時40分鐘內從黃色暴雨轉發紅色暴雨警告，其後在11時05分發出黑色暴雨警告信號，並在此前後發出山泥傾瀉警告、新界北部水浸特別報告。
香港在暴雨下多處水浸，位於新界的北區和位於香港島的東區尤為重災區。黃大仙區路面水浸嚴重，淹浸一半車身；雨水經樓梯涌入港鐵站，大堂呈瀑布狀，月台亦有積水，令黃大仙站需要提早關閉，觀塘綫來往觀塘至黃埔列車提早暫停服務。另外，香港站、南昌站、柴灣站及上水站部分出入口亦因水浸一度關閉；路面水浸和暴雨也使得部分市民整夜無法回家，滯留在商場、港鐵站乃至行人天橋。
在新界大埔，林村河嚴重水浸，水位貼近行人路；沙頭角多個村落水浸，水深至胸口位置，有消防員到場救援。在港島，柴灣多條斜路變成急流，有市民在路上跌倒被沖至幾十米遠。當區街上不少死火車輛，亦有停車場水浸近車頂；有大廈電梯因入水未能運作。紅磡海底隧道的港島入口亦水浸，過海車輛涉水而行。
港政勞工處在7日晚上9時56分曾發新聞公報，提醒僱主應盡早訂明僱員在暴雨下的工作安排。8日凌晨2時30分，政府始發出新聞公報，指會在早上6時前公布是否須停工停課。行政長官李家超指十分關注嚴重水浸情況，已指示各部門全力應對。截至8日凌晨1時，渠務署接獲12宗水浸個案。此外，港鐵指會在可行情況下進行清理及修復工作，並在頭班車前通知列車服務安排。
凌晨4時，在暫停深宵及通宵服務後，兩大主要巴士公司九巴、城巴及龍運巴士皆宣佈日間巴士服務暫停直至另行公布，新大嶼山巴士宣佈其部份日間路線將提供有限度服務。電車公司早晨5時宣佈暫停服務。5時37分，港府宣佈今日停課不停工，並呼籲僱主採取彈性工作安排。港鐵則於5時40分宣佈觀塘綫石硤尾至彩虹站暫停服務。
7日深夜11時44分，港府公布接獲深圳有關當局通知，深圳水庫將於8日0時0分排洪，新界地區可能水浸；社會大眾關注排洪前16分鐘通報是否恰當。理論上，深圳水庫的排洪將首先經由深圳市羅湖區內的河道，再進入深圳河排向後海灣。但深圳河水系連通香港境內位於北區的梧桐河、平原河和其支流，因而會為北區帶來水浸。
初時，深圳水庫排洪流量為每秒70-80立方米，但到凌晨3時15分，深圳市三防指揮辦公室發布緊急通告，指因「深圳水庫水位已超過汛限水位」，於3時15分開始將排洪流量加大到每秒120立方米，並要求「福田區、羅湖區組織相關人員遠離河道區域」。
深圳當地此前預報未提及大暴雨的可能性。《深圳商報》旗下的「深圳新聞網」在6日晚間發布的預報稱「預計6日夜間至7日降雨增多，雨勢整體較平緩，但降雨持續時間較長」。但7日下午15時，深圳龍崗、鹽田、羅湖等區已經出現特大暴雨，鹽田區3小時內累計雨量達235毫米，部分地區出現內澇。當晚22時，深圳氣象台發布暴雨紅色預警並宣布全市進入暴雨緊急防禦狀態。
記者瀏覽部分深圳羅湖區居民的微博發現，羅湖區在凌晨2時之後有居民發文稱所在區域斷電甚至斷水。官方微博號「大灣區新聞」表示一些羅湖居民需要被轉移到臨時避難場所。穿過羅湖區中心的深圳河支流布吉河也漲水超過兩側堤岸，微博用戶「J_F_o_n_g」表示稱鄰近的「人民公園」被淹。
截至本文發稿為止，官方尚未通報大暴雨和浸水的具體損失。深圳電視台節目「第一現場」採訪的應急管理局官員表示，水庫排洪長度要視後續降雨決定，可能要持續約十小時。
除了港深兩地以外，颱風海葵的餘波已造成廣東省東部多地暴雨。據報導，東莞鳳崗鎮已出現水浸。《南方日報》旗下的南方網報導，9月5日至9月7日12時，揭陽、汕尾、梅州、潮州等地累計雨量已達300毫米以上，多地發出暴雨紅色預警信號。中國氣象台下屬的中國天氣網報導稱，強降雨導致汕尾城區、惠來惠城等地出現內澇；中央電視台則報導稱梅州市豐順縣道路塌方、積水嚴重，部分居民被迫轉移；揭陽市揭東區的新西河水庫已決定於9月8日排洪以降低水位。
值得注意的是，媒體上少見有關粵東地區降雨的報導，微博等社交平台上也少見相關討論。此前深圳綜合開發研究院的一篇文章曾提到，粵東地區是欠發達地區，基礎設施建設相對落後。
此前，海葵已造成福建中南部與寧德地區出現暴雨與大暴雨，福州市區亦出現積水，造成福建159.16萬人受災，29.41萬居民被迫轉移。
