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據北韓官方媒體朝中社報導，北韓外務省禮儀局3月7日宣布，將暫時禁止北韓境內的馬來西亞公民出境，而馬來西亞隨後亦宣布，將禁止北韓駐馬使館工作人員出境，圍繞「金正男遇刺案」展開的兩國外交風波進一步升級。
3月4日，馬來西亞政府曾將北韓大使姜哲列為「不受歡迎人物」，勒令他在48小時內離境。馬來西亞外長阿曼（Anifah Aman）宣布驅逐令時說，面對任何侮辱、詆毀該國聲譽的行為，大馬都將採取強烈反應。
姜哲已於6日晚離開馬來西亞返回北韓，他在登機前表示，馬方的極端措施會對兩國四十多年的友好關係造成極大損害，又批評馬方在未經北韓許可下擅自檢驗金正男遺體，以及在證據不足之下拘捕北韓公民。
3月2日報導：馬來西亞將撤銷北韓公民免簽證入境待遇
「金正男遇刺案」觸發的馬來西亞及北韓外交風波升級。3月2日，馬來西亞副總理扎希德（Ahmad Zahid Hamidi）宣布，基於國家安全理由，自3月6日起北韓民眾將不再享有免簽證入境馬來西亞的待遇。他又警告北韓使節不要利用馬來西亞作為與國際社會較勁的平台。
此前，北韓駐馬來西亞大使姜哲批評大馬拒絕交還並強行檢驗金正男遺體，是「違反人權法、國際法及外交法」舉動，與南韓等「北韓的外部敵對勢力」合謀。馬來西亞總理納吉布（Najib Razak）則批評姜哲的言論粗魯，又召回駐北韓大使以示抗議。
另外，馬來西亞警方於2日公布，因證據不足，此前拘捕的47歲北韓疑犯李中哲將被釋放及遞解出境。李中哲的扣留期限原定於週五（3月3日）屆滿。北韓日前派出前駐聯合國副大使李東日率領的高層代表團抵達馬來西亞，尋求大馬釋放李中哲、交還金正男遺體。
大馬當局日前已經以謀殺罪起訴兩名涉嫌下手毒殺金正男的女疑犯（28歲的越南籍女子段氏香、25歲的印尼籍女子艾莎），她們一旦罪成或被判死刑。大馬當局亦正追緝4名在逃北韓男子，及3名相信仍身處馬來西亞的疑犯，包括北韓駐馬來西亞大使館二等秘書玄光成（音譯：Hyon Kwang Song）。
2月28日報導：金正男遇刺案：北韓高層赴大馬交涉，兩名女疑犯將被控謀殺
2月28日，北韓政府高層代表團抵達吉隆坡，將與馬方討論歸還金正男遺體、釋放因該事件被拘留的北韓公民李中哲、發展兩國友好關係等事宜。
而馬來西亞警方也於同一天公布，金正男遇刺案的調查報告已完成，並呈交總檢察署，將於明天（3月1日）以謀殺罪正式起訴兩名女疑犯（28歲的越南籍女子段氏香、25歲的印尼籍女子艾莎）。一旦罪成，她們將面臨死刑。至於另一名北韓籍男疑犯李中哲，拘留期將於本週五（3月3日）屆滿，預計會被控串謀謀殺罪名。
南韓指金正男案為北韓國家級恐襲
2月27日，南韓國家情報院院長李炳浩就「金正男遇刺案」對國會情報委員會作匯報，他形容這次刺殺是「北韓國家級恐怖襲擊，由（北韓最高領導人）金正恩有系統地策劃」，又稱刺殺行動是由北韓國家安全保衞省和外務省負責，相信其中4名已逃回北韓的疑犯為隸屬保衞省的間諜，至於負責實際暗殺行動的疑犯則歸屬外務省。
南韓統一部於今年1月中旬披露，北韓已免除保衞省保衞相金元弘的職務，並將其軍階從四星大將貶為一星少將。李炳浩27日引述情報指，金元弘因涉嫌作假報告，在接受北韓勞動黨組織指導部調查後，目前正被軟禁，另外至少5名國家安全保衞省高官則已被「炮決」。然而，情報未顯示相關北韓官員就何事作假而觸怒金正恩，也未能確認事件是否與「金正男遇刺案」有關。
美國研究將北韓重新列入「支持恐怖主義國家名單」
此外，韓聯社27日引述南韓政府消息人士指，當天於美國華盛頓舉行的朝核六方會談韓美日團長會議上，美方表示正研究再次將北韓列為「支持恐怖主義國家」。
消息人士指，美方於2008年將北韓自「支持恐怖主義國家名單」除名後，定期研究是否有需要將其重新列入名單，而「金正男遇刺案」讓美方再次啟動了相關討論。
繼中國於2月18日宣布今年內全面禁止北韓煤炭進口後，歐盟亦於27日宣布追加對北韓制裁。歐盟對外行動署（EEAS）宣布，禁止與北韓交易煤炭、鐵和鐵礦石，禁正自北韓進口銅、鎳、銀、鋅等，並禁止任何可能有助北韓核導研發的教育、培訓、科學領域交流。
金正男中毒消息引發吉隆坡機場安全憂慮
至於金正男的死因，馬來西亞當局上週初步確認其死於 VX 神經毒劑中毒後，大馬衞生部長蘇巴馬廉（Subramaniam Sathasivam）於26日再召開記者會，稱金正男受大劑量的 VX 攻擊，導致主要器官衰竭，在機場診所已陷入昏迷、在前往醫院的救護車上已經死亡，過程僅15至20分鐘。
蘇巴馬廉解釋，人體吸收10毫克的 VX 足以致命，而相信金正男吸入的劑量遠多於此，以致他在幾分鐘內出現症狀，肌肉持續收縮、心肺很快受到影響，且「死得非常痛苦」。
另外，此前被捕、涉嫌下手毒殺金正男的25歲印尼籍女疑犯艾莎（Siti Aisyah）於25日與印尼駐馬來西亞副大使 Andriano Erwin 見面，繼續堅稱自己事前並不知曉那是一次刺殺行動。她表示，當時有人給她90美金，要求她參與一個電視節目錄製，對一名男子（即金正男）進行「惡作劇」，並以為塗在她手上、掩向金正男面部的是嬰兒油。
馬來西亞警方曾指，根據閉路電視拍下的案發經過，艾莎及另一名越南籍女疑犯段氏香（Doan Thi Huong）的行兇手法訓練有素，得手後隨即往洗手間洗手，也顯示她們知悉手上沾的是毒藥。
不過，警方亦曾指艾莎在犯案後離開機場，在的士上一度嘔吐；蘇巴馬廉則表示，當局仍在進行檢驗，以查明艾莎是否曾出現 VX 中毒癥狀。
金正男懷疑是中毒身亡的消息公布後，引發外界對案發的吉隆坡國際機場的安全憂慮。26日凌晨，大馬當局派員封鎖現場並進行全面檢查和清理，隨後表示並未發現任何危險、污染物質，宣布現場安全。但有專家指，當局應採取更謹慎的措施，包括根據機場記錄追蹤當天曾出現在案發地點的其他旅客，調查他們曾否出現 VX 中毒癥狀。