馬習會後，2015年11月21至23日，中國與台灣進行第12次貨貿協議談判，雙方因為開放產業項目、關稅配額、稅率及調適期等四大議題仍有歧見而結束。但異於往例地立即約定一個月內再談一回合，台灣兩大談判代表國貿局長楊珍妮、工業局長吳明機，甚至主動表示希望年內能有重大進展，顯見於馬英九操之甚急的情況下，年底前的第13次談判，很可能不管台灣內部質疑聲浪，一定會簽署協議，馬英九為了成就表面政績，極可能會棄守限制中國農產品輸台的底線。

台灣已確定將積極開放相對較低價的中國1510項其他工業產品進口，另可能於下次談判時同意開放的有320項農產加工品、調製食品。僅勉強堅守707項農產品，但已洩漏期待年底達成協議之下，第13次談判能否繼續堅守得住？令人堪慮。無論如何，已可預期台灣農產加工業、食品、鋼鐵、紡織、電器電纜、玻璃、陶瓷、橡膠與汽車零件等產業，將哀鴻遍野。

至於表面上守住的707項農產品，因其中約有三成即是作為農產加工品原料，一旦下游農產加工品由中國輸台取代，等同也讓生產這些農產原料的小農喪失生計。台灣政府雖表示將編列預算補助受衝擊企業渡過難關，但市場一旦被搶走，所謂補助，不過就是企業解散的遣散費而已。人民需要的可是企業得以經營，工作可以存續。