杜特尔特的毒品战争，继年初韩籍商人勒赎撕票事件后，再度与菲律宾警政漏洞产生关联。在马尼拉都会区16日的扫毒行动后，17岁的桑托斯（Kian Delos Santos）被发现陈尸瓦砾堆，身旁有一把枪和一小包毒品。警方声称他拒捕开枪引发枪战，然而根据稍后公开的监视器画面，事实上是两名警员将桑托斯拖往丧命地点的方向，和警方证词有所出入，有蓄意栽赃的可能。事件发生后菲律宾舆论哗然，朝野参众议员、天主教会连番炮轰，推特、脸书一片#JusticeforKian的hashtag（主题标签）。事件发生的前一天（15日），是菲律宾毒品战争最血腥的一夜，高达32人在警方扫毒行动中丧生。
面对前所未有的舆论风暴，菲律宾总统府改变早前“这是个案”的态度，保证启动对涉案警察的调查，并改口称“任何一位菲律宾人的死亡都是太多的，尤其是桑托斯的（不幸丧生）”。目前该辖区警察局长与涉案警员已经撤职等候调查。
菲国警军系统藕断丝连
杜特尔特毒品战争里层出不穷的警察暴力，需置入菲律宾警政体系的脉络观察。菲律宾最早的现代化警察制度，和美国殖民地的创建有密切关系；菲美战争期间，面对大量美军志愿部队将于1899年任务完毕归国的员额压力，美国殖民地机构成立岛屿保安队（Insular Constabulary），并于1901年更名菲律宾保安队（Philippine Constabulary）。这由菲籍士兵与美籍军官组成的武装部队，成为美国绥靖菲律宾反抗军的重要力量，让草创的菲律宾警察体系与军事任务开启藕断丝连的关系，影响直至当代菲律宾。
由于外部战争与内部共产党、穆斯林分离势力动荡，菲律宾保安队数度进出菲律宾国防体系编制，而双边人员频繁互调，让保安队一度与空军、陆军、海军并列为菲律宾国防四大支柱。在前总统拉蒙．麦格塞塞（Ramon Magsaysay，1953-1957）任内，和美国CIA密切合作的保安队担纲进剿菲律宾共产党的主力；旗下的尼涅塔（Nenita）突击队成为中部吕宋地区农民的恶梦，以酷刑与法外处决对待共产党嫌疑人闻名。在担任国防部长与总统期间，麦格塞塞透过精实人员、裁撤涉贪官兵等措施，有效提振军队在菲律宾民众眼中的专业形象，而亦正是在这时期，菲律宾警察体系重归准军事（paramilitary）运作的老路。