「讓我深深的一鞠躬。」馬英九面色凝重，行了一個禮。2009年12月13日，「景美人權文化園區」開幕，這個園區是台灣戒嚴時期關押政治犯的「景美看守所」，總統馬英九在當選後一年，以元首身份出席，並在致詞中，向過去在威權時代被國民黨政府迫害的受難者道歉。
另一位當年的政治犯、前副總統呂秀蓮緊跟着上台，她自己在美麗島事件被囚禁，談到來不及見母親最後一面的往事時不禁落淚，下台前，她不忘對馬英九喊話：「那時你在總統府，我是在監牢裏！」
馬英九有些尷尬。
二二八事件發生於1947年，馬英九1950年出生在香港，若論馬英九個人，其實和事件沒有任何關係。但做為國民黨的「中興少主」，馬英九必須概括承受國民黨的全部資產，二二八事件，就是其中最重要的一筆「負資產」。少了李登輝的身份優勢，出身「外省人」的馬英九，主觀希望把自己擺在「族群和解者」的角色上。
馬英九，致力族群和解論述
2005年8月，馬英九在台北市長任內第一次擔任國民黨主席。在2006年的二二八前夕，國民黨與香港鳳凰衛視合作，推出一部二二八紀錄片《春蟄驚夢：二二八還原紀事》，馬英九在片中受訪時稱二二八事件是「當時政府處置不當造成民眾抗爭，最後演變成流血衝突」。而馬英九也在國民黨內的中常會上，定調二二八為「官逼民反」。
馬英九當時曾表示，因過去十多年來政府已完成二二八道歉、建館、建碑及訂定國定紀念日、補償二千多人受難及受害者的工作，「許多問題不是靠補償可以解決」。此外，他也強調二二八並不是「省籍衝突」，他致力「族群和解」的論述。
為馬英九籌繆二二八論述的幕僚之一，是當時的中國時報總主筆楊渡。楊渡長期致力二二八真相還原，他過去採訪時接觸過許多在白色恐怖時期的政治犯，聽他們講述二二八事件時的情況，並在2005年出版《還原二二八》。 希望在大歷史下尋求對人的悲憫，楊渡在二二八事件中，挖掘了許多小人物的溫情故事，他拍攝紀錄片《尋找二二八的沉默母親——林江邁的故事》，事件引爆點者私煙小販林江邁的女兒林明珠，後來嫁給了國民黨前副總統陳誠的侍衛。他也講述本省人幫助外省人的故事，例如行政長官陳儀的外甥、台南縣曾文區長丁名楠，在二二八事件發生後如何受到了本省人保護。
走上政治檯面之後，馬英九選擇不迴避二二事件，他幾乎年年參與紀念儀式，每次必定表態道歉，但有他的場合卻總不乏抗議事件。
馬英九這樣的身段，國民黨內有人看不過去。中常委蔣孝嚴在2006年時，曾經當面向馬英九說，「國民黨不需扛下所有責任」，因為二二八事件是官逼民反，不是「黨逼民反」。馬英九回應，國民黨是二二八事件當時的執政黨，完全置身事外，外界很難接受，表現寬容大度一點，對黨比較有幫助。蔣孝嚴認為「二二八是國民黨做的」的說法，將使國民黨的支持者流失。
不過對比蔣孝嚴的想法，他的弟弟、曾任東吳大學校長的章孝慈（編按：兩人為蔣經國非婚生子女，原本皆從母系姓章，章孝嚴後來自行改姓蔣）對二二八卻另有一番擔待，時間甚至早於馬英九。
已故的阮美姝是二二八受難家屬中非常活躍的一位，她的父親是時任《台灣新生報》總經理阮朝日，在二二八事件中遭殺害，留下無盡傷痛。1992年，章孝慈透過關係聯絡上阮美姝，希望向她請教二二八事件史實真相。一聽是「蔣介石的兒子」，阮美姝第一時間就拒絕了。但之後對方一再來電，阮美姝最後勉強同意讓章孝慈每週一次到她家「上課」。
「原本以為罵幾次他就不會來了，」阮美姝接受媒體訪問時回憶自己在給章孝慈上課時，一開始是「邊罵（蔣介石和國民黨）邊上」，章孝慈多半時間只是低頭做筆記，聽她責罵，這堂「課」一上就是一年。
章孝慈1993年開始將自己對二二八「和解」的心意付諸行動，在東吳大學舉行「二二八音樂追思會」，還引介阮美姝到東海、清華等校園講述二二八事件；阮美姝也同意了章孝慈的請求，認了他做義弟。
1996年章孝慈因中風於54歲早逝，阮美姝則在去年年底辭世。這對「姐弟」為台灣「二二八論述」留下了一段「和解」的典型。
儘管沒有直接證據證明馬英九的「二二八論述」受到章孝慈的啟發，但倆人的路徑卻極為一致。不過章孝慈只是學者，馬英九是政治領袖，他必須面對、處理支持者的感受，而馬英九的二二八論述，確實造成部分藍營支持者的失望。
馬英九任內，並沒有再出版新的官方研究，二二八事件紀念基金會也並未對陳水扁時期的基金會所做的《二二八事件責任歸屬研究報告》，進行論述的翻轉。然而那份歸屬報告中，指蔣中正是二二八「元凶」的說法其實並不被國民黨認同。
「馬英九年年哭，我投書建議他到空軍烈士公墓，他就是沒有去。他不敢到（因二二八殉職的警察）許天寶面前行禮。所有外省人的感懷，還有對他的攻擊，都會因為一個鞠躬而化解，但他完全是知其然而拒絕做，是一個相當懦弱的領袖。」
輔仁大學新聞傳播學系系主任習賢德激動地說道。
攝影棚裏，媒體人及政治評論者郭冠英正在製作一部二二八紀錄片，訪問習賢德。郭冠英在錄影前對他說道，「請你等一下說明，當時為什麼群眾會打嘉義機場？警察怎麼被打死的？這根本是場『暴亂』。」習賢德的開場白說道，如果有機會回到1947，他想問二二八事件的參與者，一個最重要的問題：「你殺了外省人沒有？」
郭冠英問到「民眾為什麼打嘉義機場」，所指的是二二八事件過程中，嘉義地區民眾組織的武裝部隊，企圖佔領嘉義水上機場，與國民政府軍隊發生激烈戰鬥的那一場事件。
而習賢德1997年時，在「碧潭空軍烈士公墓」的第945號墓位，發現了空軍烈士許天寶的墓碑。《空軍忠烈錄》中對許天寶的死因，僅以一行記載：「台灣二二八事變，抗拒暴徒，被槍擊，殉職。」但他經考證得知，許天寶就是當時一名保衛嘉義水上機場而被民兵槍擊致死的警察。
1997年習賢德將已故空軍許天寶的故事，投書《聯合報》，不久後接到一位何邱蕙老太太的書信，向習賢德表示她的先生跟許天寶，是同一個時間保衛嘉義基地的警察。因此，習賢德開始了口述史計畫，他一一拜訪1945年10月來台接收警務的「中央警校台幹班菁英」，記錄他們在二二八事件中，第一線目擊的情況。這份口述歷史在2012年出版成《警察與二、二八事件》。
他的文章，引起了對岸人士的注意。曾有一位安徽的老太太自稱是二二八受難家屬，寄信來問習賢德，台灣的補償金如何申請，習賢德無奈回道：「對不起，你們一毛拿不到」，那些警察並不在賠償範圍裏。
而習賢德在訪談中也提及，因為對國民黨執政的失望，使許多藍營支持者在2016年大選不出來投票。他說，「獨派的對手們，說二二八是政治改革；有人說官逼民反，官逼會逼到民眾去佔領水上機場？我身為空軍子弟，深深不以為然。」
馬英九任內，並沒有再出版新的官方研究，二二八事件紀念基金會也並未對陳水扁時期的基金會所做的《二二八事件責任歸屬研究報告》，進行論述的翻轉。然而那份歸屬報告中，指蔣中正是二二八「元凶」的說法其實並不被國民黨認同。現任中國國民黨黨史館館長王文隆就認為「陳儀才是元凶」，「當時蔣中正顧着打國共內戰，有很多事情要顧，陳儀欺上瞞下，蔣中正信任陳儀才派兵來台。」
馬英九任內擔任總統府副秘書長的羅智強則表示，過去國民黨保衛、建設台灣，並推行民主化，使得現在人們可以紀念二二八，「歷史評價應該要以功過的聚合來看」。而現在的國民黨已經不是威權體制下的國民黨，民進黨不該將二二八當作政治資本，來指責現在的國民黨。
2015年二二八紀念日，馬英九任期將屆，新任台北市長柯文哲以二二八受難者家屬身份，出席「中樞紀念」儀式致詞時，憶起受迫害的祖父數度哽咽無法言語。馬英九在柯文哲下台後，伸了兩次手，想跟柯文哲致意，柯文哲沒有反應，最後揮了一揮手，表示拒絕。
馬英九的「二二八論述」自始就夾在藍綠之間。他遭逢的尷尬處境伴隨着他八年職務，直到將總統職務交卸給帶領民進黨重返執政的蔡英文。
蔡英文，落實轉型正義
「噠、噠、噠、噠……」遊客的喧嘩聲漸弱，他們都拿起了相機。
踢着正步、整齊劃一的儀隊進場，帶進了一股肅穆的氣氛。這是中正紀念堂固定的憲兵交接儀式。接着，憲兵步入紅色地毯區域，對着9.8公尺高的大型蔣公銅像行禮，再轉而面對眾人操槍。但這樣的景象，在不久後將步入歷史。
現任文化部長鄭麗君在今年二二八紀念日前，宣布中正紀念堂將停售前總統蔣中正的商品，也停止播放〈蔣公紀念歌〉。文化部也將在半年內提出「國立中正紀念堂管理處組織法修正草案」，來處理中正紀念堂的「轉型」問題。鄭麗君說，政府推動「轉型正義」過程中，應避免再複製「威權文化崇拜」。
「轉型正義」是蔡英文任內重要的政策目標。2016年5月20日，蔡英文總統就職時，誓言要三年內要完成「轉型正義報告書」。但是，落實轉型正義的《促進轉型正義條例》如今還躺在立法院內，而哪個主管機關來做轉型正義？轉型正義的對象是誰？如何做？因此還未成定案。
蔡英文執政後，薛化元被行政院任命為二二八事件紀念基金會的董事長。薛化元說轉型正義分成三部分：針對事件的「真相調查」，處理事件的「責任歸屬」，最後藉教育、文化、傳播等等工作，達成世世代代「不再犯歷史的錯誤」。薛化元也說，他希望能將陳水扁時期二二八事件紀念基金會所出版的《二二八事件責任歸屬研究報告》，增補最新史料及研究結果後，以政府的「層級」發表成為正式的官方責任歸屬報告。而陳儀深則認為，「關於蔣中正的功過，都已經寫過了」，層級的問題不是重點，重要的是，執政者對於執行「轉型正義」不畏社會上的反對聲音，需要具備相當的魄力。
而在《促進轉型正義條例》通過前，基金會也組成了「二二八論述小組」，對未足夠的「真相」進行討論。陳儀深說，面對待挖掘的真相，會議達成共識，提出「二二八死傷人口」及「外省人受害情況」兩個重點。
但藍綠政治鬥爭對研究者帶來的是更多阻礙。像是陳儀深就遇過這類問題，「不意外，我們社會還是有光譜兩極的存在嘛，已經很習慣了，」擁有多次筆戰經驗的陳儀深，口氣很輕鬆。他接着說，「其實，228許多真相史實已經在那裏，但部分人不願意接受，我們的社會還需要多一點對話。」
而什麼時候台灣歷史記憶中的分歧才能夠消弭？交通大學客家文化學院人文社會學系教授柯朝欽在《記憶與遺忘的鬥爭》當中寫道，要以「真相的挖掘」，以及化為「共同的歷史記憶」作為，取代懲罰或報復的手段。對紀念物的破壞可以作為顛覆主流論述，但是激情過後，我們要思考的是，轉型正義所追求的普世價值——人權、正義與和平。