针对台湾海军金江舰因误射雄三导弹（台称雄三飞弹），造成渔船船长死亡一案，台湾高雄地方法院检察署经两个月的侦办，8月29日认定全案为过失意外，并没有其他阴谋或不法动机。检方依涉嫌过失致死罪等罪起诉按下导弹发射键的中士高嘉骏，依涉嫌废弛职务酿成灾害罪起诉射控士官长陈铭修及兵器长许博为。而舰长林伯泽则没有过失、不被起诉。
台湾国防部同日也公布行政调查报告，总结了意外发生的四大教训。包括未依规定全程督导系统操控作业、轻忽防险机制、任务分配欠周、干部专业训练及督管强度不足等。
检方表示，事故当天是高嘉骏首次登舰实战考测，为此高嘉骏已连续几天睡不好，打算在正式上场前，请陈铭修再陪他演练一遍。没想到却在陈铭修暂离时，在“作战模式”下误射导弹。当时高嘉骏被巨大发射响声吓呆，未再继续操作。检方称，本案未查出其他事证，难以断定高有故意发射的意图。
7月1日早上，隶属海军131舰队的金江舰在准备演练作业时，误射1枚“雄风三型反舰导弹”（Hsiung Feng III），击中于澎湖海域作业的高雄籍翔利升渔船，造成船长黄文忠死亡和3名船员受伤。因此案涉及国安问题及两岸情势，其后海军司令部及高雄地检署成立专案小组，调查整起事件。
雄三导弹事件因牵涉许多不为一般民众熟知的专业细节，所以民间流传“故意制造”误射事件的阴谋论，只是主谋与目的各不相同。例如有人臆测是亲国民党人士刻意趁总统蔡英文出访时制造事端，让民进党政府陷入两岸紧张关系。也有人将矛头指向中国或亲中的“内贼”，认为此事件提供中国对台施压的借口，也泄漏了台湾导弹的参数设定。甚至有人认为是美国刻意在南海仲裁结果公布前，借由激化两岸对立，让台湾选边站。
高雄地检署于29日侦查终结。调查指出，兵器长许博为明知当日的测考项目，仅需模拟发射1枚导弹，且舰上仅有2部“测试训练器”（TTS）可使用，最多仅需为测考导弹准备2支火线安全接头。但许博为却提供射控士官长陈铭修4支火线安全接头，并在预见可能酿成灾难的情况下，让陈铭修全数接上第1至4号导弹。
后来因导弹操控台上的TTS面板有异状，4支火线安全接头一开始先被拆下，再由高嘉骏全数接上。排除故障后，陈铭修在已连接火线安全接头、且导弹操控系统为“作战模式”下，完成选弹程序并测试导弹回路。后来他因口渴擅自离开战情室，高嘉骏在没有长官督导下，独自进行导弹系统演练，结果导致该舰第3号雄三导弹点火脱离弹箱，于2分钟后经自动搜索锁定目标范围内的翔利升号渔船。
检方表示，兵器长许博为未尽其职责，指示射控士官长陈铭修应遵守标准安全作业程序。其与陈铭修也未在系统处于“作战模式”时，全程在场督导。陈甚至擅自离开战情室达5至7分钟之久，留高嘉骏单独一人于战情室演练。两人均涉嫌触犯刑法第130条废弛职务酿成灾害罪。
而高嘉骏则未注意火线安全接头于“作战模式”下连接实弹后，必须有长官在场督导，才能开始测试。甚至于操作时始终未发现第3号及第4号导弹状态已显示为“实弹”。
一连串的疏忽使高嘉骏先后按下“允许发射”、“导弹发射”及“确认”等按键，导致误射雄三导弹。检方因而起诉，高嘉骏涉嫌触犯刑法第276条第2项业务过失致死、刑法第284条第2项业务过失伤害与陆海空军刑法第58条第2项过失毁损武器罪。
而在事发当日，台湾军方就公布了军纪处分决定。包括海军司令部上将司令黄曙光在内，共有七人被处分，其中黄曙光自请记过一次，海军舰队指挥部中将指挥官萧维民记过二次，海军一三一舰队舰队长胡志政少将记过两次，林柏泽、许博为各记大过一次，陈铭修、高嘉骏各自记大过两次。
对此判决，渔民家属表示没有意见，只希望军方尽快完成赔偿协商，让被炸渔船完成报废，他们才能另造新船，回归正常生活。