連月來的喀什米爾邊境衝突，引發印度和巴基斯坦的關係愈趨緊張。9月29日，印度軍方行動主管 Ranbir Singh 召開新聞發布會，公布在28日晚曾對喀什米爾地區的恐怖分子進行「外科手術式打擊」（surgical strike）。他指出，印方早前收到可靠情報，顯示有恐怖分子將自巴基斯坦越過「印巴控制線」（Line of Control）滲透印度並發動恐襲，因此採取打擊行動以防患未然。
Ranbir Singh 又稱，打擊行動已取得成效，恐怖分子及其支持者傷亡慘重，目前已經停止打擊。他強調，印方採取今次跨境反恐行動前，已按現行機制，致電通知巴基斯坦軍方作通報。
然而，巴基斯坦軍方發言人指，印方說法「毫無根據、純屬謊言」，又指印方根本沒有發動所謂針對恐怖分子基地的「外科手術式打擊」，相反在「印巴控制線」一帶無端地向巴方士兵開火，而巴方也作出了「強硬而恰當」的反擊，但交火導致至少2名巴方士兵死亡。巴基斯坦總統謝里夫（Nawaz Sharif）譴責印度的做法是「無端和赤裸裸的侵略」。
反恐專家、新德里衝突管理研究所（Institute for Conflict Management）所長 Ajai Sahni 認為，印度29日披露軍事打擊行動的做法前所未有，其目的是為了獲得國內民眾和國際社會的支持，以便未來採取更多針對巴基斯坦的行動。而受印巴邊境衝突的影響，29日的印度 Sensex 指數盤中一度下跌2％，盧比兌美元也下跌0.7％至66.845盧比，均創下6月份以來最大跌幅。
印度此次行動被視為對巴基斯坦縱容激進分子的報復。9月18日，4名武裝分子向印控喀什米爾地區的軍事基地發動攻擊，造成至少17名印軍士兵死亡。儘管目前未有任何組織宣稱對此事負責，但印度軍方稱襲擊者並非印度人，而是來自位於巴基斯坦的伊斯蘭恐怖組織「穆罕默德軍」（Jaish-e-Mohammad），且襲擊者裝備標註着「巴基斯坦製造」。印度總理莫迪（Narendra Modi）聲言，必定會讓襲擊者受到懲罰。
印度內政部長辛格（Rajnath Singh）表示，對巴基斯坦政府支持恐怖組織感到失望，更直指巴基斯坦是一個應被孤立的「恐怖主義國家」。巴基斯坦外交部發言人 Nafees Zakaria 則反駁，稱印度的指控「未經調查、毫無根據、不負責任」；巴基斯坦國防部長 Shoaib Gujjar 更暗示，18日的襲擊事件由印方自導自演，旨在轉移大眾對喀什米爾問題的關注。
喀什米爾主權問題
事實上，去年印巴關係曾一度回暖。2015年12月9日，印度和巴基斯坦發表聯合聲明，宣布將恢復雙邊高層和平談判；同月，印度總理莫迪突然訪問巴基斯坦，成為11年來首位到訪該國的印度總理；同時，巴基斯坦總統謝里夫亦表明有意推動巴印開放貿易。
然而今年7月，親巴基斯坦、主張喀什米爾脫離印度的武裝組織「真主穆斯林游擊隊」（Hizbul Mujahideen）的指揮官 Burhan Wani 與印度軍隊交火時喪命，引發印控喀什米爾地區持續數月的警民衝突，導致超過70名平民喪生。巴基斯坦政府就事件對印度作出批評，印度政府則反指巴基斯坦政府縱容恐怖組織，兩國關係再度惡化。
剛剛結束的 G20 峰會和聯合國年度會議上，印巴兩國都曾就此進行交鋒。9月21日，謝里夫在聯合國大會上呼籲讓喀什米爾自決；印度常駐聯合國第一秘書 Enam Gambhir 則回應稱巴基斯坦是一個「恐怖主義國家」，透過「長期以來贊助恐怖主義的政策」對印度犯下「戰爭罪行」。
除了軍事打擊，印度也作外交報復
連日來，印度亦通過外交手段抵制巴基斯坦。9月26日，莫迪要求水務官員將三條經印度流至巴基斯坦的河流——印度河、傑赫勒姆河和奇納布河——的用水量調到《印度河水協定》（Indus Waters Treaty）中規定的最大值65％，從而影響位於下流的巴基斯坦農地和水電項目的水量供給，並單方面暫停了印巴用水爭議仲裁專員（Permanent Indus Commission）會議。
《印度河水協定》是印度與巴基斯坦間的水資源共享協議，1960年9月16日由印巴兩國領袖及世界銀行簽署。巴基斯坦已於9月27日向世界銀行投訴，稱印度的做法破壞了相關協定。
此外，印度外交部還在9月28日表示，基於巴基斯坦「日益增長的邊境恐怖襲擊和對成員國內部事務的干預」，印方決定抵制11月在巴基斯坦首都伊斯蘭堡召開的南亞國家峰會（SAARC）。孟加拉國、阿富汗和不丹亦表明不會出席這次會議。
