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因在2014年发起“318攻占立法院行动”引发后续“太阳花学运”，事后被台北地检署依煽惑他人犯罪、妨害公务等罪嫌起诉的立委黄国昌、学运领袖林飞帆、陈为廷等22人，于3月31日上午由台北地方法院一审宣判全部无罪。
北院行政庭长廖建瑜解释，本次无罪判决的主要依据是台湾首次引用的“公民不服从”概念；他表示，法院审理案件时，详细审酌了黄国昌等人提出的“公民不服从”抗辩理据，认为本案符合相关概念，有正当事由，不具实质违法性。
他又指出，“公民不服从”包括7项要点：
- 抗议对象是与政府或公众事务有关的重大违法或不义行为；
- 须基于关切公共利益或公众事务的目的；
- 抗议行为须与抗议对象间具有可得认识的关联性；
- 须为公开及非暴力行为；
- 须有适当性原则，即抗议手段须有助于诉求目的的达成；
- 须有必要性原则，也就是没有其他合法、有效的替代手段可以使用；
- 要符合狭义比例原则，也就是抗议行动所造成的危害，须小于诉求目的所带来的利益，且侷限于最小可能的限度。
这个判决，从宪政民主的高度，肯认了公民精神与行动。
法院审判后，多名被告在法院门外召开记者会。黄国昌表示，这场官司不是针对他个人的审判，而是对于这场面对宪政危机的公民自救运动的判决，无罪判决在司法史上具有宪政意义。林飞帆则表示，此次判决是下一轮民主改革的重要准备，而学运期间的攻占行政院及路过中正一分局运动的起诉案，也都应判无罪。
陈为廷则对执政民进党发出呼吁。他指，3年前的这场运动是因为两岸服贸协议而起，然而民进党至今还没有通过监督条例，甚至没有任何审查动作，还频频退缩，修改民间版监督条例的严格审查机制，以及删除政治谈判的相关公投规定等。他认为民进党政府应尽速推动两岸监督条例。
2014年3月17日，时任国民党立委张庆忠在立院内政委员会上，在30秒内宣布完成《海峡两岸服务贸易协议》审查，引发关注此议题的学生及社会人士反弹。3月18，在林飞帆、陈为廷等的带领下，反服贸群众冲进立法院展开为期24天的抗议，期间又发生了323行政院流血冲突、411路过中正一分局事件。事后，台北地检署针对此三宗案件起诉逾百人。
在蔡英文政府上台后，行政院长林全以太阳花学运属“政治事件”而非法律事件为由，决定针对323行政院案撤告。但学运领袖魏扬等21人被控的妨害公务、毁损公物、煽惑他人犯罪、窃盗等罪，因非告诉乃论，由台北地方法院继续审理，将于4月10日下午4时宣判。
2016年5月24报导：太阳花学运126名被告获撤诉，台湾朝野反应不一
2014年3月至4月台湾“太阳花学运”期间，部分学运人士闯入并占领行政院，后因此被起诉。时隔两年，5月23日，台湾行政院发言人童振源宣布，行政院长林全在20日上任后批出的第二份公文，就是撤回对126名太阳花学运人士的起诉。
童振源引述林全表示，太阳花学运是“政治事件”，而非单纯的法律事件，应在“多一点和谐、少一点冲突”的原则下尽量从宽处理， 因此决定撤告。
他还引述林全表示，太阳花学运诉求已普遍成为社会共识，立法院也依诉求对两岸协议监督条例进行立法，凸显太阳花学运的正当性与社会贡献。
立法院长苏嘉全于23日表示，社会对太阳花运动的诉求持正面看法，对于行政院的做法，立法院“基本上还是尊重”的。总统府发言人黄重谚也于24日表示，太阳花学运是深化台湾民主的重要里程碑，支持行政院撤回对太阳花学运人士的控诉。
过去政府不做，就由现在政府来做。
2014年3月23日晚上7时左右，部分反服贸群众和学生爬入行政院，在行政院正门前广场静坐抗议。社运组织“黑色岛国青年阵线”随后在 Facebook 宣布占领行政院；台湾清华大学研究所学生魏扬宣称是占领行动的总指挥。
警方在24日凌晨展开强制驱离行动，过程中与学运人士发生肢体冲突；警方还开动镇暴水车，以水柱驱离学运人士。后经行政院评估，驱离过程中约有107人受伤，包括学生与警察，另学运人士闯入行政院破坏公物，造成约300万新台币损失。
台北地检署于2015年侦办此案，依侵入建筑物罪起诉魏扬等93名被告；部分人被指窃取行政院内的浓烟逃生袋、以手机拍下行政院公文、对警员呛声、破坏行政院的门等，依窃盗、妨害公务、毁损等罪名被起诉。
对于今次相关学运人士被撤诉，国民党文传会副主委王鸿薇于23日表示，行政院以政治方式解决司法案件，是纵容民众入侵公署、损害公物，认同群众以违法手段达到政治目的，国民党对此深表遗憾。
王鸿薇还表示，新政府在第一个上班日，即以政治考量撤告，未经法律层面的广泛讨论就草率决定，是不负责任的做法，并指：“如果行政公署都可以攻占，那么新政府可下令各机关不必再设置驻卫警了。”
民进党立法院党团书记长陈亭妃则表示，太阳花学运是民众对自己国家的未来发声，但（当届）政府不听，所以民众才走上街头。时代力量立法院党团总召徐永明也表示，撤诉是正面的事情，希望林全进一步追究当时警察殴打学生跟民众的责任。
率领占领行政院行动的魏扬表示，撤诉代表政府肯定公民不服从的权利。太阳花学运领袖林飞帆也在 Facebook 表示，撤诉是很好的开始，而他更期待的是学运的诉求能真正落实于新政府施政中，包括两岸协议监督条例的六大主张，以及公民参与宪政改革的实质推动。
曾参与太阳花学运的时代力量执行党主席黄国昌也表示，相关决定代表林全承认学运对台湾民主的重要贡献，个人给予林全“相当高度的评价”。
声音
这个问题本来就不完全是一个法律事件，学生运动本来就有很多社会问题和政治问题在里面。
林全撤告是严重的错误，打击执法人员士气，应对林全依渎职罪提告。
既然林全已公开阐述太阳花学运为政治事件，并非单纯法律事件，呼吁检察官对于因反黑箱服贸涉讼的案件应予以撤回起诉。
感谢新政府的这个决定；就我个人而言，司法结果如何并不足惧，无论结果如何我们都会承担，我期待的是新政府的善意，也能实践于三一八运动里那些尚未被完成的诉求。