7月13日，國際特赦組織（AI）發表報告指出，埃及國家安全局（NSA）為了恐嚇和消除政治異見，大舉搜捕學生、政治活動人士和示威者，將他們監禁並施以酷刑，其中最年輕的只有14歲。報告指，自2015年至今已有數百名埃及公民「被強行消失」。
報告指，大部分「被強行消失」的都是埃及前總統穆爾西（Mohamed Morsi）的支持者。穆爾西是埃及史上首位民選總統，來自埃及穆斯林兄弟會（下稱埃及穆兄會），但在2013年被軍方發動政變推倒，目前因暴力對待示威者、越獄、間諜等多項罪名而被監禁，而埃及穆兄會亦再次被剝奪政黨資格，並被定性為恐怖組織。
任何敢於發聲的人都面臨危險，反對恐怖主義已經成為一個藉口，以此綁架、恐嚇和折磨那些挑戰威權的人。
報告引述一些埃及民間組織指，平均每天有3至4名埃及公民遭秘密逮捕，他們通常被身穿便裝的 NSA 特工，帶領着攜帶重型武器的安全部隊軍警闖入家中強行帶走，其中大部分「被失蹤」公民被帶到位於國家內政部總部大樓的 NSA 秘密辦公室審問、關押。該大樓位於埃及首都開羅，接近2011年「埃及革命」中示威抗爭群眾的主要據點——解放廣場（Tahrir Square）。
報告詳盡列出了其中17位被關押者的經歷，最長的被關押7個月。其中14歲埃及男孩 Mazen Mohamed Abdallah 在去年9月30日在開羅家中被 NSA 特工帶走，並被指控為埃及穆兄會成員、參與了非法抗議活動。Mazen Mohamed Abdallah 聲稱，在審訊期間曾受嚴刑逼供，在他否認指控後，又曾遭虐待，包括被電擊。報告又引述許多曾被關押的埃及人稱，被關押期間長期被戴上眼罩和手銬。
報告又指，被關押者都不能接觸家人、律師或任何獨立司法監管機構。有些家庭曾向內政部和檢察官上報家人失蹤，但絕大部分案件都沒有開展調查，而即使當中極少數有立案調查，一旦發現相關人士是被 NSA 拘禁，調查就會不了了之。
國際特赦組織中東及北非項目主任 Philip Luther 表示，報告披露了對埃及檢察官的尖刻批評，他們與當局侵犯人權的行為串通，並違背埃及法律賦予他們的職責。
Philip Luther 又指，在埃及現任總統塞西（Abdel Fattah el-Sisi）和內政部長加法爾（Magdy Abd el-Ghaffar）領導的政權下，「強行失蹤」已經成為埃及「國家政治的關鍵手段」。加法爾在去年3月才出任內政部長，早年埃及獨裁總統穆巴拉克（Hosni Mubarak）掌權時，加法爾曾負責國家安全調查工作，即當時惡名昭彰的秘密警察部隊。2011年「埃及革命」的抗爭活動就始於1月25日的埃及「國際警察日」，以示對警察貪污、濫權、秘密拘捕異見者、虐待被捕人士的不滿。
埃及政府否認指控，反斥國際特郝組織散播謠言
國際特郝組織的報告，還特別提到意大利博士生里格尼（Giulio Regeni）的案例。28歲的里格尼自今年1月25日、即「埃及革命」成功推翻穆巴拉克的5週年紀念日當天，在開羅失蹤；2月3日，里格尼的屍體在開羅近郊高速公路上被發現，身體表面有多處傷痕，懷疑死前曾遭虐打。
有意大利媒體報導指，里格尼可能因其正從事的埃及獨立貿易工會及工運相關研究，而成為埃及警方的目標。近月來，意大利政府持續要求埃及當局交待事件，但埃及堅稱是排外犯罪組織殺害了里格尼，且該組織成員於3月已在警方一場圍剿行動中全部死亡，但就一直未能交出確實證據。事件演變成意埃兩國的外交風波，包括意大利於4月7日召回駐埃及領事，以抗議埃及未有全盤交待事件真相。
而據國際特赦組織成員 Felix Jakens 稱，里格尼身上有傷痕，與其他曾遭埃及 NSA 審訊、嚴刑迫供的人相似，而「他的案例只是冰山一角」。Jakens 還表示：「恐怕里格尼是遭埃及安全人員綁架，並折磨致死。直到對此事展開獨立調查之前，這種懷疑只會持續發酵。」
就國際特赦組織的報告，埃及政府曾作出回應，重申當局沒有侵犯人權，否認曾使用「強行消失」的秘密拘捕手段，也沒有對被捕者施以酷刑，並強調 NSA 是在埃及的法律規定下執行任務。埃及政府在回應中更加控訴國際特赦組織「散布謠言」，以及支持埃及穆兄會等恐怖組織。
聲音
我只想知道我的兒子是死是活。
你覺得你可以討價還價？我們可以殺了你，然後把你放在一個籃子裏丟進任何一個垃圾桶。沒有人會問起你。
報告表明了埃及的安全部門和司法權力機關同流合污，串通掩蓋嚴重侵犯人權的行為。