5月6日，世界卫生组织（WHO）总干事陈冯富珍致函台湾现任卫生福利部部长蒋丙煌，邀请其率团以观察员身份参加23日至28日在瑞士日内瓦的第69届世界卫生大会（WHA），但信中特别提及“一个中国原则”，引发台湾舆论争议。
5月8日，台湾候任行政院发言人童振源对此作出回应，称台湾会接受邀请，将指派准卫服部长林奏延率团与会，但认为“一中原则”与台湾与会并无关联。
回顾联合国大会2758号决议及世界卫生大会25.1号决议，依据其中所叙述的一中原则，我希望邀请您率领来自中华台北卫生福利部之访团，以观察员身份参与第69届世界卫生大会。
童振源还代表即将于5月20日上任的新政府发表了四点立场，包括台湾是依据健康这一基本人权和普世价值参与WHO，不应受任何政治框架的限缩；WHO邀请函中提到的“一中”原则和台湾参与WHA并无关联；台湾将继续参与WHA及相关会议，但不代表接受一中原则立场；要求政府继续对WHO在邀请函连结“一中原则”的不必要做法进行交涉。
此外，他还回应了中国大陆国台办发言人马晓光6日的发言。马晓光当时称，台湾之所以能在2009年以来参与WHA大会，是在两岸都坚持“九二共识”和一个中国原则的政治基础上所作的特殊安排。他还说，今年大陆能够安排台湾继续与会是大陆释放的善意，如果今后这项政治基础遭到破坏，台湾参会的安排将“难以为继”。对此，童振源表示严正抗议，称无法接受该说法。
今年是台湾自2009年参与WHA大会以来收到邀请最迟的年份，此前一度有消息指台湾今年将不会获邀。今年WHA大会的时间刚好在蔡英文新政府正式就职3日之后，而WHO却邀请了现马英九政府的卫生福利部部长蒋丙煌。
收到邀请后，台湾陆委会曾回应称，大陆方面要求WHO给台湾参会设定条件是“不智之举”。而台湾前驻欧盟代表、前外交部政次高英茂则批评大陆“这么小气”，“给台湾穿小鞋”。
9日，中国官媒人民日报海外版发表文章《面对“九二共识” 蔡英文不能再装睡》，回应“小鞋”一说，称大陆仍愿意WHO给台湾发出要求，已经是给民进党留了一扇门。
声音
（台湾）政府所主张“一中”就只有中华民国，大陆方面应正视两岸分治的事实，我方也从未认同大陆所谓的“一中原则』。
面对一直不承认一中原则的民进党新当局，大陆还愿意给出转圜空间，这是“小鞋”还是“机会”，民进党自己掂量就好。
台湾人民的健康与充分参与国际社会的权益，绝不能以任何政治框架加以限缩。