港大学生会、港大校友关注组，港大教师及职员会和18个专业团体，于10月9日晚在港大中山广场发起黑衣集会，主题是“坚守院校自主，不容黑手介入”。大会指现场有逾千人出席，明报前总编辑刘进图、香港记者协会主席岑倚兰、作词人林夕、香港商业电台首席智囊陈志云等都出席了集会。
集会以“港大校委会管治危机与改革”论坛开始，首位发言嘉宾为前立法会议员、大律师吴霭仪，她在发言中表示，反对港大校委会成员李国章成为下届校委会主席，又表示这并非针对个人，而是针对校委会制度崩坏。
明报前总编辑刘进图在发言中称，校委会有社会、道德及法律责任对否决决定向公众给予充分解释。他表示，除非校委会能指出副校长物色委员会错在哪里，否则按程序就需要尊重物色委员会的推荐。
今天刚刚出院的作词人林夕也前来参加集会，他称表达政治不需要“勇于表达”，不将政治带入校园的真义，就是师生能在校园中像讨论其他任何议题一样讨论政治。
港大校友关注组召集人叶建源表示，希望透过集会让校委会明白，否决陈文敏为任命的决定不得民心。他又称，港大毕业生议会下月将举行第二次特别会员大会，议案包括向校委会主席梁智鸿及反对陈文敏出任副校长的成员表示不信任等。
港大教师及职员会也表示，将会于就是否接受校委会决定进行民调，并已向500多名会员发出问卷，会视民调结果商讨下一步行动。
港大学生会会长冯敬恩表示，将于10月26日至30日发起公投，议案分别为“港大校委会主席必须由教师、职员及学生接受的人选出任”及“李国章不适合在香港大学管治架构”。
集会前一天，约60名来自香港中文大学、浸会大学及理工大学的学者成立“学术自由学者联盟”（以下简称联盟），关注香港大专院校的学术自由。
联盟成员在记者会上表示，港大校委会否决陈文敏副校长任命的决定横蛮无理，是政权干预学术自由的表现，要求校委会清楚交代否决任命陈文敏的理由。
陈文敏被否决出任港大副校长一事，敲响了港大以至香港学术自由的丧钟，令香港学术自由危在旦夕，学者将联合起来拨乱反正，守护学术自由。
9月29日，港大校委会以12票反对、8票赞成、1票弃权，否决任命副校长物色委员会推荐的唯一人选、前港大法律学院院长陈文敏。会后，港大学生会会长冯敬恩披露，校委们否决的理由包括陈文敏没有博士学位、学术水平不足、操守有问题等；在7月学生冲击校委会会议时跌倒的校委会委员卢宠茂，还指责陈文敏事后没有对他表示慰问。
联盟认为事件显示整个香港学术自由危在旦夕。联盟成员、岭南大学文化研究系教授陈清侨亦指出，事件不是个别院校之事，而是各大院校之事，学者们希望保障的也不只是个人权益，还有整个院校的自主，并呼吁公众关注。
联盟成员、港大法律学系首席讲师张达明，点名批评《文汇报》及《大公报》在港大校委会讨论副校长任命前夕高调抨击陈文敏。他表示，港大教师政见一向存在不同，但大家都彼此尊重，“不会因为政见而不可做什么职位”。
对于接下来的工作，联盟透露将在近期展开多项活动，包括举办研讨会、研判怀疑侵犯学术自由的个案等，就大专院校学术自由状况、管治模式提出改善建议。联盟还强调，将讨论改革殖民时期遗留下来的港督（回归后为特首）任校监的条例，且不排除参与罢教等行动。
否决任命陈文敏的决定也在港大校内引起反弹。10月6日，2000多人参与了在港大校园内进行的“黑衣游行”；10月9日晚，港大学生会、港大教师及职员会、港大校友关注组等将再度发起守䕶港大集会，抗议“政治黑手”干预院校自主。
声音
大学代表对真、善、美的追求，需要建基于学术自由之上，若学术自由被打压，以上价值亦会随之失去。
对部份校委那种轻率和尖酸的言论感到悲哀……或许这正反映了学位与人格修养和办事能力没有必然关系。
我没有参与事件，难以辨别双方指控的实据，但事件后期已经变得政治化，即使校委会通过物色委员会建议，陈文敏日后也难以处理人事问题。