6月15日，路透社和CNN都引述匿名执法部门信源，指奥兰多枪击案凶手马丁（Omar Mateen）的妻子莎尔曼（Noor Salman）告诉FBI马丁曾说想发动“圣战袭击”，但否认自己对其袭击计划知情。报导还指，FBI 不认为她是枪击案的同谋，但她可能因为对即将发生的犯罪行为知情不报，而面临检控。
我想你可以这么说，她（指莎尔曼）现在绝对是利益相关者，而且似乎在调查中可以提供一些重要的信息，例如他（指枪手马丁）是谁，他的动机是什么，他的计划是什么。
Fox电视台更引述消息称，马丁在夜店行凶过程中，有可能曾和莎尔曼通过电话。
美国司法部和FBI的调查人员正调查莎尔曼的银行账户及其他证据，以决定是否检控她，但目前尚未将其拘捕。莎尔曼是马丁的第二任妻子，两人在2011年结婚，住在皮尔斯堡（Fort Pierce），有一个3岁的儿子。
莎尔曼正配合多个执法部门调查马丁的作案动机等，她对FBI说自己曾注意到马丁行为的改变，并试图说服他不要做出暴力行为。她还指，马丁在11日，也就是枪击案前几小时离开家，但没有如实告诉她自己要去 Pulse 夜店。
不过路透社指，莎尔曼告诉FBI自己曾经开车载马丁去过 Pulse 夜店。CNN 的信源更指，莎尔曼曾陪同马丁去过多个可能发动袭击的地点“踩点”，尽管莎尔曼不一定知道马丁去这些地方的动机。这些地点包括他们4月26日到访的奥兰多迪士尼乐园，以及6月初到访的Pulse 夜店和奥兰多大型娱乐购物中心“迪士尼之泉”（Disney Springs）。马丁在12日发动袭击前又最后去了一次“迪士尼之泉”，不过是单独去的。
调查显示，马丁在枪击案中使用的枪械也是在6月初购买的。不过美国参议院情报委员会成员 Angus King 说，不清楚莎尔曼有没有陪同马丁去买枪。但可以确认的是，莎尔曼向FBI承认，马丁买弹药和手枪皮套的时候，她也在场。
莎尔曼现年30岁，其父母据信是来自巴勒斯坦的移民，1970年代从约旦河西岸搬到美国加州，直到和马丁结婚后才搬到佛罗里达州。邻居称，她从小成长于一个家境良好的穆斯林家庭，家中共有三姐妹，其父亲多年前因心脏病去世，母亲则与14岁的小女儿居住在一个中产社区。FBI已经到访了她母亲的住所。
美联社指，执法部门目前正在调查莎尔曼是否曾与任何事前知晓袭击计划的人有过交谈，并在证实莎尔曼和马丁最近是否曾到访过 Pulse 夜店。
随着多家媒体引述知情人说马丁是 Pulse 常客甚至本人就是同性恋，路透社引述两个匿名信源指，FBI已经在调查，马丁是不是因为自己隐藏的同性恋倾向而发动袭击。
马丁的父亲在案发后曾公开指马丁恐同，并举例说他曾在迈阿密街上被两个亲吻的男人激怒。美联社引述心理学研究指，在反感同性恋的家庭长大的同志，可能因为压抑对同性的渴望而有反对同性恋的表现。
由于案件牵涉宗教、恐怖主义、同性恋等多个因素，他的作案动机仍未明确。
声音
他（指马丁）似乎是一个愤怒、不安、情绪不稳，然后激进化了的年轻人。
我不相信他（指马丁）是那什么──随便你们怎么叫吧。
我看到他（指马丁）开枪打死了我旁边的一个女孩，我当时躺在那儿想：“下一个就是我了，我死了。”