台灣中央流行疫情指揮中心昨日（2月16日）晚間公布兩起新冠肺炎本土確診案例，台灣累積確診數量人數達到20例，其中第19例因肺炎合併敗血症於15日晚間死亡，為台灣目前首例死亡個案。值得一提的是，這是一例「沒有疫區旅遊史、仍被確診」的病例，乃是鑑於新加坡、日本出現「無旅遊史確診」個案，台灣政府遂主動出擊，進而檢出的病例。
指揮中心指揮官、衛福部長陳時中指出，該名61歲男性病例有糖尿病及B型肝炎病史，無出國旅遊史，亦非確診病患密切接觸者，於1月27日出現咳嗽症狀、2月3日因呼吸急促就醫，當時診斷為肺炎，收治於負壓加護病房治療，於15日死亡。
陳時中表示，眼見鄰近的新加坡、日本陸續出現無相關地區旅遊史的確診個案，疾管署為了防止台灣出現社區感染，自2月12日起，主動採檢1月31日後通報的「流感併發重症個案」，共計113例，一一檢驗有無感染新冠病毒，進而在這113例中，發現了死亡的第19例個案，依據該案接觸史追蹤接觸者並進行疫調，因而進一步確認了第20例病例。
該名死亡的病例為白牌車（非法營業自用車、即沒有牌照的計程車）司機，春節期間曾載運多名自中港澳地區返台過年的台商，其中有3位乘客已出現呼吸道感染症狀就醫，指揮中心目前正深入追蹤其密切接觸者。
「如果沒有這樣及時發現，可能會造成社區感染，疫情會更加嚴重。」陳時中在昨日的記者會上做出上述表示。但陳時中也強調，台灣目前的狀況，還未能確定即是社區感染，相關單位仍在確認當中，呼籲台灣民眾不要過度恐慌。
社區感染的定義為「民眾在社區裡面行動就有感染風險」，前提有四：一、確定病例無法找到感染來源，目前正在清查中；二、本地感染個案數遠超過境外移入個案數，目前是「遠低於」；三、已出現持續性的傳播鏈，目前無此狀況；四、有廣泛發生（wide spread）的群聚事件等，目前無此狀況。陳時中表示，以現有資訊分析，台灣目前尚未有大規模本地感染數，一般民眾於社區得到感染的風險很低，尚無須提升防疫等級，只要落實肥皂勤洗手、避免觸摸眼鼻口，做好咳嗽禮節、減少近距離接觸、保持環境清潔及通風，就能有效預防感染。
在這一波檢驗過程當中，政府亦循這名死亡的19例患者，找出了台灣第20例「無症狀確診」病患。第20例患者為第19例之51歲弟弟，於15日採檢後確診，但目前仍無症狀。
其餘18名確診個案中，有2名已康復出院，16名個案病況穩定，持續住院隔離中。
在這段期間中，台灣指揮中心於15日起將中國河南、浙江省二省新增為一級流行疫區，與湖北省、廣東省同列，其他省份與港澳地區為二級流行區。由於日本近期發生多起感染源不明的個案，指揮中心研判日本可能已經出現隱性社區傳播，14日起將日本旅遊疫情建議提升為第一級注意（Watch），籲民眾應遵守當地一般預防措施；截至目前為止，各地旅遊疫情建議如下：日本和泰國為第一級注意、新加坡為第二級警示（Alert，至當地應採取加強防護措施）、中港澳為第三級警告（Warning，應避免至當地所有非必要旅遊）。
台灣自2月6日起實施的「口罩實名領取」制度也已邁入第二輪購買週期。民眾每隔7日可持健保（全民健康保險）IC卡至健保特約藥局購買兩片口罩，售價為新台幣10元。為緩解藥局壓力，自2月16日開始各地區的衛生署也開放領取實名制口罩。
由於台灣口罩資源有限，目前幾乎全數由政府統一徵用、分配，網友亦針對實名制發起「我OK，你先領」的口罩禮讓運動，呼籲健康的人不需要戴口罩，可將口罩留給第一線人員，獲得超過萬人響應。
疾管署則反覆提醒民眾，戴口罩可遵循「一不三要」原則——戶外通風良好處不用戴口罩；慢性病患、有呼吸道症狀者、進出醫院或人多擁擠的地方要戴口罩。不少民眾亦紛紛響應，目測街道上戴口罩的民眾比例略有下降。
目前台灣約有2萬人正處於居家隔離、檢疫狀態，衛福部為了提供民眾隔離檢疫期間的心理諮商，招募專業護理志工，截至2月14日止已有542人報名，並於當日開始進行「疫情關懷Call Center」任務，提供居家隔離檢疫者電話關懷。衛福部呼籲，居家檢疫者返家後將由村里長、里幹事進行每日健康關懷，並非具症狀的疑似病例，民眾無須恐慌，並應給予檢疫對象支持、鼓勵與關懷。
在2003年SARS爆發期間，台灣8個民間團體自發組成「社會安全防疫聯盟」，並製作「防疫行動手冊」，補足政府著重醫療及個人層面以外的社會支援體系。
當年參與其中的愛滋感染者權益促進會秘書長林宜慧回憶，當時社安聯向社會大眾呼籲社區、親友要多多關懷強制居家隔離者，「協助倒垃圾、送餐都是很重要的」，除了定期加油打氣、以電話或電子郵件問候之外，因居家隔離者無法外出，與外界隔離也容易感到苦悶，鄰里及親朋好友亦可主動提供娛樂活動，如書報、收音機、運動器材、玩具等，帶動「守望相助」的氣氛。
林宜慧談到，目前台灣對於新冠肺炎的疫情控制相較SARS期間好上許多，但歧視的狀況仍有，她舉出柯文哲洩漏武漢台商返台隔離地點後，周邊的文化大學校長及學生會發出反對言論為例，認為「社區的支援與支持相當重要」，若社會對於可能染病者歧視、缺乏支援，就可能造成隱匿病情、形成防疫漏洞。
台灣流行病學專家、中研院生醫所兼任研究員何美鄉也在臉書上發文提醒，不應率爾將這名無旅遊史的司機視為台灣已進入社區感染的徵兆，「這位載過中港澳乘客的司機，接觸到高風險族群的機率很高。因此，他雖是本土病例，但我們不應草率認定他是追溯不到源頭的社區感染。」何美鄉分析，「假如此時，我們誤判疫情的局勢，過早認定社居（區）感染，那將造成人民焦慮，難以正常生活，讓我們變成一個不具產能的社會，更會引起國際拒絕台灣人入境，讓台灣在國際上更動彈不得。」
由於日本鑽石公主號發生群聚感染，並有3名台籍人士確診，指揮中心已於2月6日宣布禁止國際郵輪停靠台灣港口，交通部也於2月7日宣布，自2月10日至4月29日將暫停除北京、上海、廈門及成都外的兩岸客運航班往來。鑽石公主號自2月1日發現首起確診新冠肺炎病例後，2月4日起停留在橫濱港大黑埠頭，船上人員進行個人艙房隔離14日，截至2月16日，船上人員已有355名確診，這是中國大陸以外確診人數最多的群聚感染；據了解，郵輪上共有22名台籍遊客與2名台籍船員。
指揮中心執行官、疾管署署長周志浩昨日表示，由於鑽石公主號14天隔離期將滿，台灣將會派出華航包機接回船上19名未確診的台灣旅客，至於確診的3人會先留在日本接受治療。另外，2月3日搭乘首批武漢包機返台的台商團，也即將於17日結束集中檢疫，目前247名台商中僅一名確診新冠肺炎，其他成員則繼續於檢疫場所中接受密集健康監測。
因應新冠肺炎疫情依然持續升溫，各國確診案例不斷攀升，指揮中心昨日也宣布即日起只要自境外返台後出現呼吸道症狀或發燒者，醫師都可以針對個案採檢；同時，指揮中心也啟動「社區監測方案」，針對「14天內有國外旅遊史（包含新加坡、泰國及日本及其他國家）或曾接觸來自國外有發燒或呼吸道症狀人士接觸史，且醫師高度懷疑COVID-19感染之發燒或呼吸道症狀個案」、「發燒／呼吸道症狀群聚現象者」及「『抗生素治療3日未好轉且無明確病因』、『群聚事件個案』或『醫護人員』之肺炎個案」具感染風險之3大群體，加強採檢送驗。