6月15日，路透社和CNN都引述匿名執法部門信源，指奧蘭多槍擊案兇手馬丁（Omar Mateen）的妻子莎爾曼（Noor Salman）告訴FBI馬丁曾說想發動「聖戰襲擊」，但否認自己對其襲擊計劃知情。報導還指，FBI 不認為她是槍擊案的同謀，但她可能因為對即將發生的犯罪行為知情不報，而面臨檢控。
我想你可以這麼說，她（指莎爾曼）現在絕對是利益相關者，而且似乎在調查中可以提供一些重要的信息，例如他（指槍手馬丁）是誰，他的動機是什麼，他的計劃是什麼。
Fox電視台更引述消息稱，馬丁在夜店行凶過程中，有可能曾和莎爾曼通過電話。
美國司法部和FBI的調查人員正調查莎爾曼的銀行賬戶及其他證據，以決定是否对她提出檢控，但目前尚未將其拘捕。莎爾曼是馬丁的第二任妻子，兩人在2011年結婚，住在皮爾斯堡（Fort Pierce），有一個3歲的兒子。
莎爾曼正配合多個執法部門調查馬丁的作案動機等，她對FBI說自己曾注意到馬丁行為的改變，並試圖說服他不要做出暴力行為。她還指，馬丁在11日，也就是槍擊案前幾小時離開家，但沒有如實告訴她自己要去 Pulse 夜店。
不過路透社指，莎爾曼告訴FBI自己曾經開車載馬丁去過 Pulse 夜店。CNN 的信源更指，莎爾曼曾陪同馬丁去過多個可能發動襲擊的地點「踩點」，儘管莎爾曼不一定知道馬丁去這些地方的動機。這些地點包括他們4月26日到訪的奧蘭多迪士尼樂園，以及6月初到訪的Pulse 夜店和奧蘭多大型娛樂購物中心「迪士尼之泉」（Disney Springs）。馬丁在12日發動襲擊前又最後去了一次「迪士尼之泉」，不過是單獨去的。
調查顯示，馬丁在槍擊案中使用的槍械也是在6月初購買的。不過美國參議院情報委員會成員 Angus King 說，不清楚莎爾曼有沒有陪同馬丁去買槍。但可以確認的是，莎爾曼向FBI承認，馬丁買彈藥和手槍皮套的時候，她也在場。
莎爾曼現年30歲，其父母據信是來自巴勒斯坦的移民，1970年代從約旦河西岸搬到美國加州，直到和馬丁結婚後才搬到佛羅里達州。鄰居稱，她從小成長於一個家境良好的穆斯林家庭，家中共有三姐妹，其父親多年前因心臟病去世，母親則與14歲的小女兒居住在一個中產社區。FBI已經到訪了她母親的住所。
美聯社指，執法部門目前正在調查莎爾曼是否曾與任何事前知曉襲擊計劃的人有過交談，並在證實莎爾曼和馬丁最近是否曾到訪過 Pulse 夜店。
隨着多家媒體引述知情人說馬丁是 Pulse 常客甚至本人就是同性戀，路透社引述兩個匿名信源指，FBI已經在調查，馬丁是不是因為自己隱藏的同性戀傾向而發動襲擊。
馬丁的父親在案發後曾公開指馬丁恐同，並舉例說他曾在邁阿密街上被兩個親吻的男人激怒。美聯社引述心理學研究指，在反感同性戀的家庭長大的同志，可能因為壓抑對同性的渴望而有反對同性戀的表現。
由於案件牽涉宗教、恐怖主義、同性戀等多個因素，他的作案動機仍未明確。
聲音
他（指馬丁）似乎是一個憤怒、不安、情緒不穩，然後激進化了的年輕人。
我不相信他（指馬丁）是那什麼──隨便你們怎麼叫吧。
我看到他（指馬丁）開槍打死了我旁邊的一個女孩，我當時躺在那兒想：「下一個就是我了，我死了。」