中國當局因魏則西事件成立了兩個官方調查組，分別對互聯網巨頭百度公司和武警北京市總隊第二醫院（下稱武警二院）進行調查。5月9日，兩個調查組分別發布了調查結果。
由國家網信辦會同國家工商總局、國家衞生計生委成立的聯合調查組表示，百度競價排名機制存在付費競價權重過高、商業推廣標識不清等問題，影響了搜索結果的公正性和客觀性，容易誤導網民，必須立即整改。消息公布後，百度盤前價一度暴跌8％至160美元。
調查組對百度提出了3項整改要求：
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全面清理整頓醫療類等事關人民群眾生命健康安全的商業推廣服務。違規信息一經發現立即下線，不得對未獲得主管部門批准資質的醫療機構進行商業推廣。
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改變競價排名機制。在2016年5月31日前，提出以信譽度為主要權重的排名算法並落實到位；對商業推廣信息逐條加註醒目標識，並予以風險提示；嚴格限制商業推廣信息比例，每頁面不得超過30%。
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建立完善先行賠付等網民權益保障機制。暢通網民監督舉報渠道，提高對網民舉報的受理、處置效率；對違法違規信息及侵害網民權益行為，一經發現立即終止服務；建立完善相關機制，對網民因受商業推廣信息誤導而造成的損失予以先行賠付。
調查組還在公告中表示，國家工商總局將加快出台《互聯網廣告管理暫行辦法》，用於規範互聯網廣告市場秩序。
百度隨後做出回應，稱「堅決擁護調查組的整改要求，深刻反思自身問題，絕不打一絲折扣」。除了承諾全面審查醫療類商業推廣服務、改以信譽度為主價格為輔的排序機制、每頁面商業推廣信息條數所佔比例不超過30%、對商業推廣信息進行醒目標識和風險提示、建立對醫療內容的評級制度等整改要求，百度還表示將增設10億元保障基金，對網民因使用商業推廣信息遭遇假冒、欺詐而受到的損失經核定後進行先行賠付。
由國家衞計委、中央軍委後勤保障部衞生局、武警部隊後勤部衞生局聯合成立的調查組表示，武警二院存在科室違規合作、發布虛假信息和醫療廣告誤導患者和公眾、聘用的李志亮（魏則西的主治醫生）等人行為惡劣等問題。
調查組作出四項處理決定：
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立即終止與上海柯萊遜生物技術有限公司的合作，對武警二院其他合作項目運行情況進行集中清理整頓。
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勒令涉及武警二院的合作方，停止擅自發布虛假信息、各類廣告和不實報道。
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對10名負有責任的相關人員依紀依法作出嚴肅處理。其中，給予武警二院2名主要領導行政撤職處分，給予醫院其他6名人員行政記過和行政記大過處分，對上級負有監管責任的2名領導分別給予行政警告和行政嚴重警告處分。此外，對地方2名涉嫌違法犯罪人員，移交司法機關處理。
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在武警二院開展依法執業宣傳教育和紀律整頓，完善規章制度，規範執業行為，加強內部管理，改進行業作風，舉一反三，全面清理整治。
武警二院自5月4日起已停業。
聲音
百度最新成立搜索公司，有信心、有決心以此為新徵程、新起點，與不良信息進行長期的堅決鬥爭，為廣大用戶提供更簡單、更便捷、更值得依賴的搜索服務。
魏則西本質上是被防火墻（GFW）害死的！
調查組確認百度對魏則西就醫負有誤導責任，責令百度整改。我的觀點：1、競價排名應和普通搜索分列明示，而不是只規定比例；2、競價排名要明確說明是廣告，而不是含糊其辭說是推廣，而且百度有提示風險的義務。不管怎麼說，魏則西總算沒有白死，他開始改變了歷史。建議將來出台的規定命名為魏則西條款。