國民黨於10月17日的臨時全國代表大會上廢止了洪秀柱的總統參選人資格，但有綠營立委以此事涉嫌違反台灣《總統副總統選舉罷免法》（選罷法）為由，將國民黨主席、總統參選人朱立倫等告上法院。最高法院檢察署特別偵查組（特偵組）於10月21日首次傳喚朱立倫，朱立倫稱會勇於面對「造謠抹黑」，並批評發起訴訟的綠營濫用司法資源。
台灣真的不要司法濫用，也不要用這樣的方法干擾總統大選……台灣的民主如果用這樣的方式，藍營立委也可以去告綠營總統候選人，讓她去跑特偵組？
國民黨「換柱」過程中被傳以5億元新台幣勸退洪秀柱，而洪秀柱「不接受任何私下交換條件」的言論也引來聯想。民進黨立委陳亭妃及台灣團結聯盟（台聯）立委周倪安，近日分別向台灣最高法院告發朱立倫等人涉嫌違反選罷法第84條。該條款規定，「對於候選人或具有候選人資格者，行求期約或交付賄賂或其他不正利益，而約其放棄競選或為一定之競選活動者，處3年以上10年以下有期徒刑，併科新台幣2百萬元以上2千萬元以下罰金」。
特偵組將兩案合併處理，於21日首度傳喚朱立倫、洪秀柱、國民黨秘書長李四川、前洪秀柱辦公室顧問葉匡時等人說明情況，其中朱立倫被兩度傳喚。有消息稱是由於其中3人說法不一，但朱立倫的律師李永裕表示，這是因爲第一次訊問時有些問題沒有問到，檢方希望朱立倫折返說明，並稱「今天所有疑點都已經得到釐清」。
朱立倫在首次接受訊問後表示，國民黨臨時全國代表大會公開透明、作為坦蕩，自己將勇敢面對所有造謠抹黑。他又批評相關事件已影響到自己的行程。朱立倫在成為總統參選人後，計劃於11月出訪美國。但有媒體指出，目前他雖被調查，但未被限制出境，因此認為訪美行程不會受影響。
洪秀柱和李四川也在離開特偵組後接受媒體訪問。洪秀柱否認存在交換條件和握有朱立倫勸退的錄音，並稱「外界傳言污衊是不可以的」；李四川也表示洪秀柱沒有拿出任何錄音，而自已向檢察官說明了相關問題。
面對相關人員一致否認，告發此案的民進黨立委陳亭妃於22日再次爆料，有2名關鍵證人了解朱立倫、李四川、洪秀柱三人的「談判」錄音，她會再向特偵組告發。
有台灣法律界人士分析稱，特偵組在案件被告發後不到一周就將告發人、被告人和證人都全部傳喚完畢，意味案件將在近期偵結，而如果該案沒有新的人證或事證提出，將無法繼續偵查。
聲音
現在非初選期間，也完全沒有不正利益或賄賂，因此，朱立倫沒有違反總統副總統選舉罷免法相關法條的問題。
當事人尊重司法是好事情，但也希望不要隨便提告，提來提去最後整個都亂掉了。
總統選舉不是兒戲，提名要有基本程序，先前換人有很大爭議，至今爭議未平息，難不成（國民黨）又要換人了嗎？