凌晨2時半，票站關了，投票完了，各個候選人打氣的聲音也沒了，不過這屆選舉沒有因此變得寂靜；2016年香港立法會選舉爭議不斷，質疑選舉不公、票站職員處理馬虎的聲音此起彼落。
在9月4日投票日，選舉事務處接獲2200宗投訴，其中500多宗與投票資格或安排有關，包括有選民報稱「被投票」。究竟這個選舉機制還健全嗎？不少人都拋出這個疑問。
晚上近9時，吳小姐再次回到上水石湖墟聖公會陳融中學的N1302票站。她落寞地看着票站，想起她那張無效的選票。
選民「被投票」：身份證資料被盜用？
吳小姐向端傳媒說，她下午6時已來到票站準備投票。然而，當她向票站職員遞上身份證登記時，卻發現在選民名冊上，自己的名字已被劃上紅線，代表有人用了她的資料投票。
吳小姐隨即向票站主任投訴，強調自己未投票。她指票站主任知悉後，「一直在翻一本很厚的英文書本」，估計是票站指引。接著，票站主任建議吳小姐填寫表格，向選舉事務處投訴，「但至少要過了投票日，才能遞交給選舉事務處，不知什麼時候有回覆」。
「選舉制度出了問題，不排除是人手失誤，或者是選舉流程的漏洞。」吳小姐回想說。
那吳小姐怎樣投票呢？幾經安排，票站職員給她一張蓋了紅印的「替代選票」，「意思是我可以投，但那張票在點票時不會有效」。吳小姐不滿地說：「這很離譜，那麼我就只能享受投票過程嗎？」隨後吳小姐也向了廉政公署投訴。
住在沙田的朱先生，同樣遇到類似的情況，但這次，他卻是令別人未能投票的一個。
下午3時，朱先生到沙田第一城林漢光中學R0501票站投票。不過，7小時後，他的孖生哥哥到同一個票站投票，票站職員卻說他已經投票，不能再投票。
朱先生的哥哥立刻投訴，票站職員最後承認「刪錯了名字」，但釐清事件後，已經過了10時半的投票事件，「我哥哥最後也沒辦法投票，他當然深深不忿」。
「我排隊時，票站職員已經搞了很久，花了兩分鐘才給選票我，我真的不知道為何他們仍然出錯，刪了我哥哥的名字。」朱先生說。
選舉管理委員會（下稱選管會）主席馮驊，深夜3時半見記者，回應有選民報稱「被投票」。
他相信出現這種情況，可能有三個原因：一、選民已經投票，但聲稱自己未投；二、有其他人盜用其身份證資料；三、票站職員劃線時出錯。現時票站職員為選民登記時，會在選民登記冊劃去其資料，馮驊指以往也有個別劃錯的情況，但並不廣泛，而今屆工作人員處理那麽多個案，或有機會「忙中出錯」。
然而即使出錯，馮驊承認基於選舉保密制度，無法追回問題選票。選管會會調查事件，之後再交代。
這些個案似乎不是冰山一角。一名叫Christine Tam的網民，在個人臉書發帖，指登記領取選票時，發現已有人以其資料投票，票站職員同樣建議她投「重票」，並表明點票時不會計算。
她質疑有人盜用其身份證資料投票，當場向票站主任提出：「新聞也有報導選舉管理委員會馮驊說，有人以身份證副本去投票！那我極有可能是被人盗用身份證！」
身份證副本可投票？
現行法律一直沒有規定選民必須出示身份證才能投票。9月4日早上，選舉管理委員會主席馮驊對傳媒表示，只要選民能拿出「任何選舉主任信納它，一個妥當、辨認到身份的證明文件都可以」，但選民單單出示身份證副本，就不能領取選票。
9月4日下午，端傳媒記者拿身份證副本，去荃灣大河道雅麗珊社區中心投票。甫進票站，票站職員核對了姓名、身份證號碼和照片後，向記者說理論上可以投票。但隨後票站職員追問記者是不是遺失了正本，記者回答說只是遺漏在家，職員就著記者回家拿回正本。
記者5分鐘後再回票站，向職員表示未能取回身份證副本，希望以副本投票，但遭到拒絕。
可是，參選港島區的人民力量主席袁彌明，下午在臉書專頁發放片段，指她成功以身份證副本投票，票站職員並沒有要求她出示其他身份證明文件。
馮驊在9月5日深夜3時半見記者時，再次回應事件。他重申選民不能單以身份證副本登記投票，但「如果有這種情況，我們會詳細調查」。
選票預先蓋印 馮驊：不影響選舉
至於馬鞍山利安選區監察投票代理人麥潤培，指收到選民葉小姐投訴，指她收到的超級區議會選票，在民建聯李慧琼的格子裏有個完整剔號。葉小姐隨即向票站主任反映，票站主任為這張選票，蓋上作廢印章，並承諾向上級匯報、跟進。
馮驊晚上表示自己已知悉事件，會調查，但形容「個別選票有蓋印，看不到對選舉有影響」，他不排除這是惡作劇或者有人別有用心，認為事情真偽有爭議。